Системы управления материальными потоками разрабатывают и тестируют на основе строгого анализа, основанного на нескольких основных принципах.
Принцип ориентации требует сначала рассмотреть всю систему в целом, чтобы понять, как и почему она работает, а также изучить связи с другими системами и физические ограничения.
Принцип потребности предусматривает поиск ответа на вопрос: что требуется от системы, или что она должна выполнять?
Принцип координации обуславливает интеграцию системы координацией всех операций хранения и обработки.
Принципа стандартизации важно придерживаться при выборе упаковки — выгодно стандартизировать как можно больше упаковок.
Принцип "точно в срок" гласит, что не следует перевозить продукты, пока они не понадобятся.
Принцип грузового модуля противоречит принципу "точно в срок" тем, что подчеркивает важность обработки материалов удобными для погрузки-разгрузки партиями, такими как грузовые модули.
Принцип минимального перемещения предусматривает такую организацию систем, чтобы грузы перемещались по кратчайшим расстояниям.
Принцип полного использования пространства подразумевает его рациональное использование. Существует оборудование для обработки материалов, предназначенное для заполнения пустых мест.
Принцип эргономичности требует ограждения рабочих в системах обработки материалов от выполнения тяжелых, трудных и повторяющихся действий, которые приводят к болезням, травмам или инвалидности.
Энергетический принцип предусматривает снижение энергопотребления при выполнении операций по обработке материалов.
Экологический принцип ориентирует на разработку элементов систем, "дружественных" к окружающей среде, например, выбор экологически безвредного материала для упаковки.